Sin embargo, la mayoría de los materiales de cultivo de tomate son frutos rojos, por lo que la generación de materiales con frutos rosados ​​es muy importante para la producción de tomate asiático. Los estudios metabólicos y genéticos demuestran que el rasgo rosado es el resultado de la ausencia de flavonoide amarillo naringenina chalcona (NarCh) en las cáscaras, y está controlado por el locus amarillo (Y) recesivo monogénico. La creciente evidencia sugiere que el gen Y puede codificar un factor de transcripción R2R3-MYB, SlMYB12, que actúa como un determinante clave para la acumulación de flavonoides.

El silenciamiento del gen SlMYB12 en plantas con frutos rosados ​​bloquea la acumulación de NarCh en la cáscara y da como resultado un fenotipo de fruto rosado, mientras que la sobreexpresión del gen conduce a la complementación fenotípica. Todo esto sugiere que la manipulación genética de SlMYB12 es una forma factible de cambiar el color de la fruta entre el rojo y el rosa. El equipo de Lei Deng de la Academia de Ciencias de China está trabajando en el desarrollo de tomates rosados dirigiéndose al gen SlMYB12.

Los investigadores utilizaron CRISPR-Cas9 para alterar dicho gen en líneas de tomate de fruta roja. Se desarrollaron 11 plantas de regeneración individuales, 10 de las cuales tenían al menos un alelo SlMYB12 mutado, lo que reveló una alta eficiencia de edición (90,9%). Todos los mutantes homocigotos y bialélicos exhibieron un fenotipo de fruto rosado. No se detectaron mutaciones fuera del objetivo en ninguno de los casos.