En este trabajo se presentan los resultados de una investigación sobre el efecto de las condiciones climáticas y las prácticas agronómicas en la presencia de la micotoxina deoxinivalenol (DON) en trigo duro cultivado bajo condiciones ecológicas y convencionales, así como el efecto de los tratamientos tecnológicos de molienda sobre la distribución del DON en las diferentes fracciones. Los resultados indican la necesidad de un adecuado sistema de gestión integrada de riesgos, que tenga en cuenta la gestión previa a la cosecha (buenas prácticas agrícolas), así como durante la cosecha y la poscosecha (buenas prácticas de fabricación y almacenamiento).